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古菊云提出了多种成矿规律、学术观点及理论概念；发现与总结“脉钨矿床的垂直分带—环形分带—球面分带规律”；第一个在国际会议上提出“斑岩钨矿床”的概念及其主要地质特征；牵头组建了“广州巍峰矿产应用研究所”。他还研究和开发出多项高新技术水处理产品，其中NMSTA天然矿物污水治理剂投产10多年来反复创新，已获得“中国发明专利权”，并荣获 “中国优秀专利产品”称号，及“首届香港中华专利技术博览会金奖”、“中华专利技术发展成果奖”和“首届香港国际新产品新技术博览会金奖”。
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