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以人工智能技术破译“生命密码”

来源:  发布时间:2023-12-28

——记海南大学副教授、博士生导师崔菲菲

郑 心  卫婷婷

  

  千万年来,人类与各种疾病的博弈,从来都不仅是物质的角力,更是精神的对垒。对于绝大多数人而言,地位、权力、财富、荣誉都是生活中增添幸福感的“0”,虽然可以扩大位数却毫无意义,而健康才是“1”,为所有美好赋予意义的同时,也可能顷刻间覆灭一切。正因为如此,从古至今有许多学者接续奔走在人类健康事业的大道上,为驱逐疾病献智献策。学界先后诞生出多种解开“生命密码”的方式,其种类又随着近年来人工智能、测序技术等科技的革命性发展而节节攀升:基因组学、蛋白质组学、表观组学、转录组学……不胜枚举。而为了更好地整合浩如烟海的多组学信息,生物信息学在生命科学研究领域的重要意义日益凸显。2020年于日本东京大学获得生物信息学博士学位的青年学者崔菲菲恰好是此领域内一名坚定奋发的“追梦人”,她手执智能时代催生的“智慧医疗”技术利器,立志为完善疾病预测体系、创新癌症等重大疾病诊疗模式贡献己力。

  回望崔菲菲的人生旅程,“科研梦”对她而言有一个由模糊到逐渐清晰的过程。本硕时期的计算机背景虽然给了崔菲菲扎实的学术功底,但却并未带给她一张对未来清晰明确的人生蓝图。于是,毕业之际,校园招聘会提供的稳定工作机遇轻易地吸引了她的注意。但在“一眼望到底”的人生轨道上前行一段路途之后,她却第一次感到自己在逐渐“脱力”,“我想改变当时的生活状况,那份工作非常好但激发不了我的兴趣,我渴望进入实验室,渴望将人生的航船驶向学术的海域”。这时,日本文部科学省提供的博士奖学金恰巧为她提供了走进梦想的机遇。“我非常珍惜这次重回校园的机会,所以即便跨专业也没有关系,我会拼尽全力。”崔菲菲是这么说的,也是这么做的。千余个脚踏实地、埋首书海的日夜为证,她将自己接触到的人工智能技术在生物学领域的应用手段一股脑带回了电子科技大学基础与前沿研究院,从而开启了自己的博士后研究生涯。

  崔菲菲在博士后阶段更加深入地探究了生物序列分析领域的奥秘。对藏在基因序列中的生命信息及生物学的“中心法则”,她都有了进一步的认知与理解。据她介绍,基因序列通过转录与翻译合成特定生物学功能的蛋白质,从而实现从基因序列到蛋白结构并最终到生物学功能的精准预测,因此生物序列信息的有效利用对于生物医药领域的发展至关重要,不仅对研发疾病的靶向治疗大有助益,还有望将人类对生物学机制的认知边界推向更远方。其间,她所申请的国家自然科学基金青年项目“基于多模态多任务深度学习的蛋白质-核酸相互作用的系统性预测”顺利获得立项,这进一步坚定了她扎根领域的信心与决心。带着这份坚定与开启新征程的勇气,她于2022年正式入职海南大学。

  海南这片位于我国最南端的土地虽在教育层面起步较晚,但在崔菲菲眼中却呈现一派蓬勃朝气,就如同它终年宜居的气候一般,利于成长、永葆生机。此外,20184月,习近平总书记在庆祝海南建省办经济特区30周年大会上的重要讲话更为竭力建设海南的学者们打了一剂强心针,“要支持海南大学创建世界一流学科”的号召既鼓舞了士气,也同时赋予了海南大学新的重大历史使命,使得崔菲菲深感重任在肩。于是,即便来此仅有短短一年时间,她也顺利申请到了国家自然科学基金地区项目,基于人工智能和多组学数据的研究手段,在攻治三阴性乳腺癌的研究中发光发热。

  崔菲菲十分重视对学生的培养,“我的个人经历和过去我的导师对我的培养模式奠定了我的人才理念:过去的专业不重要,只要学生具备主观能动性和对科研的热爱之心,我都十分欢迎”。如今她的团队和课堂上已是人才济济,有望青出于蓝,但她仍在致力于帮助生物信息学行业人才永续。


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